Eerder werden gevallen van co-infecties met twee varianten gemeld. Er was niet veel bekend over virale recombinatie die virussen met hybride genomen opleverde. Twee recente onderzoeken rapporteren gevallen van genetische recombinatie tussen SARS-CoV-2-varianten Denta & Omicron. De recombinant, Deltamicron genaamd, had kenmerken van beide varianten.
De term 'Deltacron' verscheen begin dit jaar1 om COVID-19-gevallen aan te duiden van co-infectie van mensen met de verschillende varianten van SARS-Cov-2-varianten, bijvoorbeeld delta en omicron. Delmicron of Deltacron verwezen naar de infectie veroorzaakt door een combinatie van “twee varianten van dezelfde virusstam, SARS CoV-2”, en er werd niet gezegd dat ze verschillend waren “stammen'.
Er zijn echter gevallen van genetische recombinatie tussen twee verschillende stammen van SARS-CoV-2 zijn onlangs gemeld. Op 08 maart 2022 onderzoekers2 meldde drie infecties in Zuid-Frankrijk met “Deltamicron” recombinant met hybride genoom dat spike-eiwit had van een Omicron-variant en het ‘lichaam’ van een Delta-variant. De hybride genoom had kenmerkende mutaties van de twee lijnen. De recombinante piek zou de virale binding aan het gastheercelmembraan kunnen optimaliseren.
Bewijs voor Delta en Omicron recombinatie is voortgekomen uit de VS3 ook. Dit team kon twee onafhankelijke gevallen van Delta-Omicron-recombinant identificeren. In beide gevallen het 5'-uiteinde van het virus genoom kwam uit de Delta genoom, en het 3'-uiteinde van Omicron.
Er wordt gesuggereerd dat de recombinante virussen niet algemeen voorkomen, noch zijn er aanwijzingen dat de recombinanten met hybride virussen genomen zijn meer overdraagbaar of virulenter dan de dominante circulerende varianten.
***
Referenties:
- Deltacron is geen nieuwe soort of variant. Wetenschappelijk Europees. Geplaatst op 9 januari 2022. Verkrijgbaar bij http://scientificeuropean.co.uk/covid-19/deltacron-is-not-a-new-strain-or-variant/
- Colson, P., c.s. 2022. Cultuur en identificatie van een "Deltamicron" SARS-CoV-2 in een cluster met drie gevallen in Zuid-Frankrijk. Preprint medRxiv. Geplaatst op 08 maart 2022. DOI: https://doi.org/10.1101/2022.03.03.22271812
- Bolze A., c.s. 2022. Bewijs voor SARS-CoV-2 Delta en Omicron co-infecties en recombinatie. Preprint medRxiv. Geplaatst op 12 maart 2022. DOI: https://doi.org/10.1101/2022.03.09.22272113
***
