Kākāpō-papegaai: voordelen van genomische sequencing Conservatieprogramma

De kākāpō-papegaai (ook wel " uilpapegaai " genoemd vanwege zijn uilachtige gelaatstrekken) is een ernstig bedreigde papegaaiensoort die oorspronkelijk uit Nieuw-Zeeland komt . Het is een bijzonder dier, want het is de vogel met de langste levensduur ter wereld (hij kan wel 90 jaar oud worden). Met een gewicht van ongeveer 3-4 kg is het ook de zwaarste, enige niet-vliegende en nachtactieve papegaai ter wereld.

De kākāpō leefde al sinds zijn evolutie in isolatie in Nieuw-Zeeland , maar zijn populatie nam snel af. In de jaren zeventig waren er naar schatting slechts 18 mannelijke kākāpō's bekend. Het bestaan ​​van vrouwelijke kākāpō's werd in 1980 bevestigd. Dankzij intensief natuurbeheer zijn de kākāpō's van de rand van uitsterven gered. In 1995 waren er nog 51 over. Tegenwoordig leven er nog 247 kākāpō's ^1,2.

Om de instandhouding te bevorderen, werd in 2015 het Kākāpō125+ project opgericht om de genomen van 125 levende kākāpō's en enkele belangrijke, recent overleden individuen te sequencen. Het doel was om het genetisch beheer van kākāpō's te verbeteren, met name om de lage voortplantingscapaciteit (onvruchtbaarheid) en ziekten die het herstel belemmerden aan te pakken. De volledige assemblage op chromosoomniveau van het referentiegenoom van een individuele kākāpō werd in 2018 voltooid ³.

In een studie die op 29 augustus 2023 werd gepubliceerd ^, meldde het onderzoeksteam dat ze de genomen van bijna de gehele kākāpō-populatie (vanaf 2018) van 169 kākāpō's hadden gesequenced, afkomstig van 125 levende individuen en 44 opgeslagen monsters. De gegevens op populatieniveau koppelen genetische diversiteit binnen de soort aan specifieke DNA-sequenties die verband houden met eigenschappen zoals ziektegevoeligheid, kuikengroei, enz. Dit zou kunnen helpen om gezondheidsrisico's eerder te identificeren en een behandeling op maat te plannen voor elke individuele kākāpō. Deze aanpak om specifieke genetische kenmerken te identificeren die cruciaal zijn voor overleving, zou kunnen worden hergebruikt voor het beheer van de bescherming van andere bedreigde diersoorten ^4,5.

*** 

Referenties:  

1. Afdeling Natuurbehoud. Regering van NZ. Kākāpō-herstel. Verkrijgbaar bij  https://www.doc.govt.nz/our-work/kakapo-recovery/ 

2. Natuurlijk geschiedenismuseum. De eigenzinnige kākāpō van Nieuw-Zeeland wordt teruggetrokken van de rand van uitsterven. https://www.nhm.ac.uk/discover/new-zealands-quirky-kakapo-are-pulled-back-from-extinction.html 

3. Afdeling Natuurbehoud. Regering van NZ. Kākāpō125+ gensequencing https://www.doc.govt.nz/our-work/kakapo-recovery/what-we-do/research-for-the-future/kakapo125-gene-sequencing/ 

4. Universiteit van Otago 2023. Nieuws – Soorten voor uitsterven behoeden – hoogwaardige kākāpō-populatiesequencing biedt een doorbraak in het begrijpen van belangrijke natuurbehoudsgenetica. Verkrijgbaar bij https://www.otago.ac.nz/news/otago0247128.html Geraadpleegd op 29 augustus 2023.  

5. Guhlin, J., Le Lec, MF, Wold, J. et al. Soortbrede genomica van kākāpō biedt hulpmiddelen om het herstel te versnellen. Nat Ecol Evol (2023). https://doi.org/10.1038/s41559-023-02165-y  Voordruk bij bioRxiv doi: https://doi.org/10.1101/2022.10.22.513130  

***