Tmesipteris oblanceolata, een soort vork varen afkomstig uit Nieuw-Caledonië in de zuidwestelijke Stille Oceaan blijkt een genoomgrootte te hebben van 160.45 Gigabase-paren (Gbp)/IC (1C = nucleair DNA-gehalte in een gametische kern). Dit is ongeveer 7% groter dan die van Paris japonica (148.89 Gbp/1C), een Japanse plant die dit record sinds 2010 had. Ter vergelijking: de grootte van het menselijk genoom is 3.1 Gbp/1C (dwz 3.1 miljard basenparen per gametische kern). ). Dus het genoom van T. oblanceolata is ongeveer 50 keer groter dan het menselijk genoom.
De varens die erbij horen Tmesipteris Op basis van aanwijzingen uit eerdere onderzoeken werd gedacht dat ze gigantische genomen hadden. Het kostte onderzoekers echter ongeveer een decennium van onderzoek naar de diversiteit van genoomgroottes bij planten om tot de huidige bevinding over de werkelijke genoomgrootte van T. oblanceolata te komen.
Er is een buitengewone variatie in de genoomgroottes van ongeveer 20,000 eukaryotische organismen die tot nu toe zijn bestudeerd. Hiervan hebben slechts enkele planten- en diergroepen genomen groter dan 100 Gbp. Longvissen (Protopterus aethiopicus) met 129.90 Gbp, en de riviersalamander (Necturus lewisi) met 117.47 Gbp zijn voorbeelden uit diergroepen. De Europese maretak (Viscum album) met 100.84 Gbp is een voorbeeld uit het plantenrijk. Interessant is dat onder de planten zes van de grootste eukaryote genomen worden aangetroffen.
Een grotere genoomomvang betekent niet noodzakelijkerwijs een groter aantal genen. Herhaaldelijke transponeerbare elementen kunnen grote genoomgroottes veroorzaken.
***
Referenties:
- Fernández, P. et al. Een vorkvarengenoom van 160 Gbp verbrijzelt het grootterecord voor eukaryoten iWetenschap. Gepubliceerd op 31 mei 2024. DOI: https://doi.org/10.1016/j.isci.2024.109889
- Institut Botànic de Barcelona 2024. Onderzoeksnieuws – Het grootste genoom ter wereld is ontdekt in een varen. Geplaatst op 31 mei 2024. Beschikbaar op https://www.ibb.csic.es/en/2024/05/the-largest-genome-on-the-planet-has-been-discovered-in-a-fern/
***
/IC (1C = nuclear DNA content in a gametic nucleus). This is about 7% larger than that of Paris japonica (148.89 Gbp/1C), a Japanese plant that had held this record since 2010. For comparison, human genome size is 3.1 Gbp/1C (i.e., 3.1 billion base pairs per gametic nucleus). Thus, the genome of T. oblanceolata is about 50 times bigger than human genome.){kind=link}